Histopathologie expérimentale

Réalisation
de vos travaux

d’histopathologie et
d’immunohistochimie

Le service d’histopathologie expérimentale est situé sur le site de l’Hôpital Purpan.

La mission du service est le traitement histologique de tissus afin de répondre aux questions biologiques des projets de recherche des chercheurs académiques et du privé.

Il est ouvert à toute personne ayant des besoins occasionnels ou permanents en histologie.

Nous traitons des échantillons tissulaires provenant de différentes espèces (murins, humains, lapins, cochons…).

Nous développons spécifiquement une expertise dans le traitement histologique des cellules cultivées sur insert (épidermes reconstruits…).

Nos expertises

Déshydratation-Imprégnation et Inclusion en paraffine, cryocongélation

Inclusion en paraffine, cryocongélation, cytospins

Techniques
de coupes

 

 Coupe au cryostat, coupe au microtome

Techniques
de colorations

 

 Coloration classique, colorations spéciales

Techniques
d’immunomarquages

 

 Immunohistochimie, immunofluorescence

Numérisation
de lames

 

Numérisation des lames en visible, en fluorescence

Lecture
de lames

 

 Lecture de lames par un pathologiste vétérinaire

Notre offre de prestations

au service de la recherche

Notre service ouvert aux académiques et aux sociétés privées propose d’effectuer des collaborations scientifiques d’histologie expérimentale adaptées à de nombreux axes d’étude et de recherche :
  • Soit le personnel du service réalise la totalité de la prestation
  • Soit le demandeur réalise la totalité de la prestation dans notre service
  • Soit le personnel du service et le demandeur réalisent chacun une partie de la prestation
Techniques histologiques et Immunomarquages

Sur échantillons inclus en paraffine, cryoconservés ou sur cellules étalées sur lames en prestations de services ou en collaboration avec notre service.

Mises à disposition des équipements

Nos équipements peuvent être réservés en ligne et leur utilisation nécessite obligatoirement une formation assurée par l’équipe du service.

Conseils et formations

Le personnel dispense des conseils et des formations à la demande, sur site pour la mise en autonomie des demandeurs aux différentes techniques et au maniement des équipements.

Développements technologiques

Nous proposons de nouvelles techniques histologiques comme par exemple de nouveaux immunomarquages en simplex ou multiplex sur lames d’histologie pour améliorer le phénotypage histologique des modèles expérimentaux des chercheurs.

Lire le règlement intérieur, demander une prestation
Réserver
un équipement
Procédure à suivre pour préparer vos échantillons
Consulter les modes d’emploi des matériels
Demander des précisions, prendre rendez-vous pour une formation

Les équipements

du service

Automate de déshydratation et imprégnation Leica Histocore Pearl

Automate de déshydratation et imprégnation Leica Histocore Pearl

Cet automate permet la déshydratation progressive des échantillons fixés grâce à des bains croissants d’éthanol puis de xylène suivi de l’imprégnation dans de la paraffine liquide. Cet équipement permet de traiter jusqu’à 200 échantillons par cycle. Les échantillons doivent être préalablement préparés selon la procédure recommandée par le service.

Cet appareil n’est pas en libre accès.
Station d’enrobage Leica Arcadia

Station d’enrobage Leica Arcadia

Cet équipement est composé de 2 modules : un élément chauffant distributeur de paraffine et une cryoconsole. Après imprégnation en paraffine, les échantillons sont inclus dans la paraffine à l’aide de cette station.

Cet appareil n’est pas en libre accès.
Cytocentrifugeuse CYTOSPIN® 4

Cytocentrifugeuse CYTOSPIN® 4

Cet équipement est un système de préparation cellulaire qui se sert de la force centrifuge pour déposer des cellules sur une lame porte-objet afin de permettre leur analyse au microscope.

L’accès à cet équipement nécessite une formation préalable. Pour cela, il suffit de prendre RDV avec le personnel du service.
Station de congélation Snapfrost

Station de congélation Snapfrost

Cet équipement permet une congélation ultra rapide des échantillons. Le système utilise de l’isopentane qui est placé dans une chambre réfrigérée jusqu’à -80°C.

L’accès à cet équipement nécessite une formation préalable. Pour cela, il suffit de prendre RDV avec le personnel du service.
Cryostat Leica CM1950

Cryostat Leica CM1950

Cet équipement est un dispositif cryogénique qui permet de maintenir une température basse allant de 10°C à -30°C, dans une zone d’expérimentation thermiquement isolée de l’extérieur qui permet la réalisation de coupes congelées de 5 μm à 40μm, à partir de matériel frais ou fixé. Les échantillons doivent être préalablement préparés selon la procédure recommandée par le service.

L’accès à cet équipement nécessite une formation préalable. Pour cela, il suffit de prendre RDV avec le personnel du service.
Microtome Leica RM2145

Microtome Leica RM2145

Cet équipement permet la réalisation de coupes de 3μm à 5μm de tissus fixés et enrobés de paraffine. L’épaisseur de coupe réalisée par défaut par le service est de 3μm.

L’accès à cet équipement nécessite une formation préalable. Pour cela, il suffit de prendre RDV avec le personnel du service.
Graveuse de lames

Graveuse de lames

Cet équipement permet d’imprimer sur les lames d’histologie les informations de la prestation (numéro de prestation, numéro de la lame, traitement de la lame). Elle permet une identification claire des lames.

L’accès à cet équipement nécessite une formation préalable. Pour cela, il suffit de prendre RDV avec le personnel du service.
Colleuse de lamelles Leica CV5030

Colleuse de lamelles Leica CV5030

Cet automate assure le montage de lamelles de verre sur les lames. Nous utilisons des lamelles dont l’épaisseur est de 0,13 à 0,17 mm et de dimensions 24 x 60 mm.

L’accès à cet équipement nécessite une formation préalable. Pour cela, il suffit de prendre RDV avec le personnel du service.
Automate de coloration Leica ST5020

Automate de coloration Leica ST5020

Cet automate permet de colorer jusqu’à 30 lames par cycle et exécuter plusieurs cycles de coloration en même temps. Les stations ont des couvercles ce qui permettent de limiter les contaminations inter-stations, l’évaporation et l’oxydation des solutions. Le contrôle qualité des colorations est assuré par un système de gestion de la fréquence d’utilisation des réactifs et la réalisation de lame contrôle à chaque nouveau cycle de coloration.

Cet appareil n’est pas en libre accès.
Scanner de lames 3DHISTECH Pannoramic Flash III

Scanner de lames 3DHISTECH Pannoramic Flash III

Cet équipement permet de numériser les lames qui ont été colorées et marquées en visible ou en fluorescence (DAPI, Cy3, Cy5, FITC). Pour cela, il suffit d’en faire la demande lors de la demande de prestations. Les lames virtuelles sont des reproductions numérisées du contenu optique d’une lame de verre histologique. La lecture se fait sur l’écran d’un ordinateur à l’aide d’un système, appelé le caseviewer, qui reproduit les fonctions d’un microscope. Le logiciel caseviewer est à télécharger dans WAPT ou ici : https://www.3dhistech.com/solutions/caseviewer/.

L’accès à cet équipement nécessite une formation préalable. Pour cela, il suffit de prendre RDV avec le personnel du service.

La documentation

à destination des usagers

Documents administratifs

Règlement intérieur

 Ce document doit être complété et envoyée par mail au service avant toute première demande de prestations.

Fiche de demande de prestations

 Cette fiche doit être complétée et envoyée par mail au service pour toute demande de prestations.

Fiche de réalisation de technique par l’utilisateur

 Cette fiche doit être complétée par chaque utilisateur après toute prestation réalisée en autonomie dans le service.

Modes d’emploi

Aide au logiciel Caseviewer

Ce document présente les différentes fonctions avancées du logiciel.

Mode d’emploi du Panoramic scanner

Procédure d’utilisation du scanner de lames

Protocoles recommandés

Procédure de prélèvement ET recOUPES des échantillons

Les échantillons doivent être prélevés et recoupés en respectant cette procédure avant d’être apportés dans le service. (Cliquez sur description en haut à gauche pour accéder à la liste des organes.)

Préparation des échantillons pour une inclusion en paraffine

Les échantillons doivent être préparés en respectant cette procédure avant d’être apportés dans le service.

Préparation des échantillons pour la cryocongélation

Les échantillons doivent être préparés en respectant cette procédure avant d’être apportés dans le service.

Publications

Identification d’adaptations clés pour la persistance des bacilles de la tuberculose chez l’hôte

 

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Allen, A.C., Malaga, W., Gaudin, C. et al. Parallel in vivo experimental evolution reveals that increased stress resistance was key for the emergence of persistent tuberculosis bacilli. Nat Microbiol 6, 1082–1093 (2021)

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Publication 3

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Publication 4

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Comment pouvons nous

vous aider ?

Vous souhaitez nous soumettre un projet, poser des questions sur les prestations, contactez-nous et nous vous aiderons à définir au mieux les objectifs, étudier sa faisabilité technique, établir le cahier des charges, et vous proposer une étude tarifaire sur-mesure. Votre projet sera mis en œuvre après validation administrative, technique et éthique.

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